ー NOVA APPLICATIONS ー
高精度のタンパク質構造予測とモデリングのための革新的なソフトウェア
NovaFold AI_AlphaFold 2
ソフトウェアラインナップ
タンパク質構造予測、抗体モデリング、タンパク質ドッキングシミュレーションのための4つのソフトウェアを提供します。
NovaFold AI
NovaFold AI は、DeepMind社 AlphaFold
2をシームレスに活用してアミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、結果を可視化・解析することができるタンパク質構造予測ソフトウェアです。
AlphaFold 2は、2020年のCASP14チャレンジにおいて、タンパク質構造予測手法として総合1位になり、実験レベルと同等の精度でタンパク質の構造を決定し、他の参加チームを大きく引き離しました。NovaFold AI の構造予測および解析は、Protean 3D の既存のNovaCloud Services のインターフェイス内で行われます。
NovaFold_I-TASSER
NovaFold
NovaFold は、ミシガン大学 YangZhang 教授の研究室によって開発された世界有数のソフトウェアパッケージである I-TASSER に基づくタンパク質構造予測ソフトウェアです。NovaFold は、スレッディングと ab initioフォールディングテクノロジーを組み合わせた I-TASSER のタンパク質構造予測アルゴリズムを利用して、Lasergene Protein と連携し、これまで構造が未知のタンパク質の正確な完全3D原子モデルを構築します。I-TASSER は、世界規模で開催されるタンパク質立体構造予測コンテスト CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) にて常に上位にランクされており、NovaFoldは I-TASSER の唯一の商用ソフトウェアです。
* 抗体構造の予測については、下記のNovaFold Antibodyをご参照ください。
NovaFold Antibody_抗体
NovaFold Antibody
NovaFold Antibody ソフトウェアは、抗体および抗体フラグメント（Fv、Fab、VH、sdAb）モデルを生成するように特別に設計されています。NovaFold Antibody のアルゴリズムは、ホモロジーモデリングとab initioによるループ構造予測を組み合わせて、非常に正確な予測を実現します。得られた予測結果は、Lasergene Protein を用いて詳細な分析を行えます。
タンパク質-タンパク質のドッキングシミュレーションが可能なNovaDock と組み合わせてご利用頂くこともできます。
NovaDock_SwarmDock
NovaDock
NovaDock は、任意の2つのタンパク質間の原子相互作用を予測する高解像度のタンパク質-タンパク質ドッキングアプリケーションです。リガンドと受容体の配列ファイルを提供するだけで、NovaDock は Lasergene Protein で分析するための高分子複合体の3次元構造を予測します。
FAQs
Nova Applications はどのように販売されますか？
Nova Applications（NovaFold、NovaFold Antibody、および NovaDock）をご利用頂くには、ご希望の予測数（Prediction）を一定のご利用期限付き使用権として個別にご購入頂く必要があります。ご希望の予測数（Prediction）とご利用期限については、弊社へお気軽にご相談ください。ご希望内容にそってお見積りのご案内を差し上げます。なお、Nova Applications で予測を実行するには、Lasergene Protein のライセンスが必要です。
Nova Applications を実行するためのコンピューターの技術要件は？
Nova Applications は、クラウド上で実行することができます（クラウド版）。お客様はDNASTAR社の専用クラウドサーバへデータをアップロードして頂くだけですので、ハイスペックなコンピューターをご用意頂く必要はありません。クラウド版については、Nova Applications のご利用に必要な Lasergene Protein の技術要件（DNASTAR Software）をご参照ください。また、タンパク質データとコンピューターリソースの管理方法に柔軟性をお求めのお客様につきましては、ソフトウェア自体をご購入頂き、ローカルサーバー上で実行できるライセンスもご用意しております（ローカル版）。ローカル版についてはこちらの技術要件を参照してください。
Nova Applications の無料トライアルを提供していますか？
はい、無料トライアルを提供しております。Lasergene Protein の無料トライアルに各Nova Applicationの1回分の予測数（Prediction）が含まれています。また、特定の研究目的に合わせて、お客様とご相談しながら無料で数回分の予測数（Prediction）をご提供することも可能です。ご希望の場合、弊社へお気軽にご相談ください。
