高精度のタンパク質構造予測とモデリングのための革新的なソフトウェア
NovaFold AI & NovaFold AI-Multimer
NovaFold AI および NovaFold AI-Multimerは、DeepMind社 AlphaFold 2
およびAlphaFold-Multimerを活用してアミノ酸配列からタンパク質構造を予測し、結果を可視化・解析することができるタンパク質構造予測ソフトウェアです。
AlphaFold 2は、2020年のCASP14チャレンジににおいて最も高く評価された単一鎖タンパク質構造予測手法であり、実験レベルに匹敵する精度でタンパク質構造を決定することで他の参加チームを大きく上回りました。また、AlphaFold-Multimer は、複数鎖タンパク質複合体(マルチマー)の構造を予測するよう最適化された AlphaFold 2
アルゴリズムの拡張版です。このアルゴリズムは、2022 年の CASP15 チャレンジ におけるマルチマーターターゲットクラスで上位 3 チームの基盤技術となりました。NovaFold AI または NovaFold AI-Multimer を通じてこれらのアルゴリズムにアクセスすることで、構造予測および解析はどちらも既存の Protean 3D の
NovaCloud Services インターフェイス内で実行されます。
NovaFold
NovaFold は、ミシガン大学 YangZhang 教授の研究室で開発された世界有数のソフトウェアパッケージである I-TASSER に基づくタンパク質構造予測ソフトウェアです。NovaFold は、スレッディングと ab initioフォールディングテクノロジーを組み合わせた I-TASSER のタンパク質構造予測アルゴリズムを利用して、Lasergene Protein と連携し、構造が未解明のタンパク質の高精度な完全3D原子モデルを構築します。
NovaFold Antibody ソフトウェアは、抗体および抗体フラグメント(Fv、Fab、VH、sdAb)モデルを生成するように特別に設計されています。NovaFold Antibody のアルゴリズムは、ホモロジーモデリングとab initioによるループ構造予測を組み合わせて、非常に正確な予測を実現します。得られた予測結果は、Lasergene Protein を用いて詳細な分析を行えます。
NovaDock
NovaDock は、任意の2つのタンパク質間の原子相互作用を予測する高解像度のタンパク質-タンパク質ドッキングアプリケーションです。リガンドと受容体の配列ファイルを提供するだけで、NovaDock は Lasergene Protein で分析するための高分子複合体の3次元構造を予測します。
Lasergene Proteinでは、どのような種類のタンパク質分析が可能ですか?
Lasergene Proteinを使用すると、 タンパク質配列解析、 タンパク質構造解析、 B細胞エピトープ予測、 タンパク質安定性予測、 および タンパク質構造アライメント を実行できます。 タンパク質構造予測、...
抗体モデリング、 タンパク質間ドッキング のワークフローも、当社の Novaアプリケーション との統合を通じて利用可能です。
Lasergene Proteinにはどのようなアプリケーションが含まれていますか?
Lasergene Proteinには、タンパク質構造の柔軟で豊富な3Dグラフィック表示を提供する Protean 3D が含まれており、 配列 および 構造解析、 タンパク質安定性予測 ツールが統合されています。Lasergene Proteinのライセンスには、...
タンパク質モデリングおよび構造予測のための Novaアプリケーション による予測がそれぞれ1回ずつ含まれています。それ以上の予測には、別途購入が必要です。
Lasergene Proteinを購入する前に試用できますか?
はい。Lasergene Proteinを含む DNASTAR Lasergene のコンプリートパッケージを無料でお試しいただけます。お試し期間中は、ご質問等ございましたらお気軽に お問い合わせください 。...
タンパク質モデリングや構造予測に Novaアプリケーション をご検討の場合はぜひご相談ください。お客様の研究目標に合わせて直接ご案内いたします。